W celu przejęcia <a action="GoToPage" data="Companies_Territories">terytorium</a> od innej kompanii należy najpierw wypowiedzieć jej wojnę. Aby to zrobić, można użyć mapy albo menu "Wszystkie kompanie". Wypowiedzenie wojny wiąże się z dużym wydatkiem monet. Wojnę może wypowiedzieć tylko kompania, która ma co najmniej jedno terytorium. Dokładny koszt jest uzależniony od wielu czynników, także od różnicy w wielkości pomiędzy kompaniami.
Wojna składa się z określonych faz, a w każdej z nich obowiązują nieco inne reguły walki.
Po wypowiedzeniu wojny rozpoczyna się faza przygotowań. Podczas tej fazy atak na drugą kompanię wciąż jest traktowany jako <a action="GoToPage" data="Mechanics_Crime">przestępstwo</a>. Ta faza zapewnia stronie broniącej się okazję do zebrania sił i zapobiega niespodziewanym atakom podczas nieobecności większości jej członków.
Po fazie przygotowań rozpoczyna się faza bitwy. Podczas tej fazy zaangażowane w konflikt kompanie mogą swobodnie atakować się nawzajem, nie martwiąc się o ewentualne kary za działania przestępcze. Ochrona terytorium pozostaje jednak nadal aktywna. Długość fazy bitwy może różnić się w zależności od momentu rozpoczęcia wojny oraz okresu oblężenia ustalonego przez obrońców.
Kolejną fazą jest oblężenie. Faza oblężenia ma miejsce podczas <a action="GoToPage" data="Companies_Siege">okresu oblężenia</a> ustalonego przez stronę broniącą się. Podczas tej fazy kompania atakująca może zignorować ochronę obowiązującą na terytorium obrońców. To oznacza, że atakujący może zniszczyć jeden ze znaków ochronnych strony broniącej się, nawet jeżeli zapłaciła ona za ochronę. Ta faza kończy się wcześniej, jeżeli zniszczony zostanie znak ochronny.
Po fazie oblężenia wojna wchodzi w fazę rozstrzygnięcia. Podczas tej fazy kompanie wciąż mogą atakować się nawzajem jak podczas fazy bitwy. Tym razem jednak kompania broniąca się może zarządzić kontratak. Jest to specjalny sposób rozpoczęcia działań wojennych, który kosztuje mniej niż pierwotny atak i odbywa się z pominięciem fazy przygotowań. Zamiast tego natychmiast po fazie rozstrzygnięcia rozpoczyna się faza kontrataku. Jeżeli nie ma kontrataku, wojna kończy się po fazie rozstrzygnięcia.
Czas poszczególnych faz wyświetla się w wyskakującym okienku, które pojawia się po wypowiedzeniu wojny i przed opłaceniem jej kosztów. Aktualną fazę trwającej wojny oraz początek kolejnej można sprawdzić w zakładce "Wojny" na <a action="GoToPage" data="Mechanics_UI">ekranie kompanii</a>.